用于治疗肥胖及肥胖伴发症的缩胃手术和用来治疗胃癌的手术有着不少相似之处，最为明显的一点就是他们都需要切除一部分胃来达到治疗的目的，在做完手术之后也都需要长时间的护理以避免手术并发症的出现，而且在做了胃癌手术之后的一段时间里，患者也可以获得一定的减肥效果，但从医生的角度来看，这两种手术却是大相径庭。
胃癌手术是在患者胃部发生癌变并处于早期时的一种治疗方式，根据患者癌变发生的位置来确定手术的位置，有全胃切除、近端胃切除、远端胃切除几种，其目的是为了防止癌变进一步扩散，且做完手术之后可能会对胃的正常功能造成影响。
而缩胃手术的手术是专门用于治疗肥胖症以及肥胖引起的各种伴发症，手术方式基本固定。
在手术时顺着胃大弯的走行方向保留2-6cm的幽门以上胃窦，沿胃长轴切除胃的大部，使残留的胃呈"香蕉状"容积在60-80ml左右，保留了胃的完成结构，不会对正常生活造成太大的影响。
从手术性质上来看缩胃手术和胃癌手术也完全没有可比性，胃癌手术是治疗性手术，就像生病了需要医治一样，同样也会有复发的可能；而缩胃手术除了治疗还具有预防的作用，做完手术之后不仅可以让患者恢复到正常体重。
。